江西省科学院创建于1958年，时为中国科学院江西分院。因历史原因，1964年被撤销。1979年，江西省科学院重新组建，是直属于江西省人民政府唯一的综合性自然科学研究开发机构。现有7个研究所：生物资源研究所、微生物研究所、能源研究所、应用化学研究所、应用物理研究所、科技战略研究所、生态流域研究所；1个产业技术研究院；3个研究中心：高科技开发中心、鄱湖阳研究中心、低碳经济研究中心。

江西省科学院现有职工500余人，专业技术人才310人，博士120人，享受国务院特殊津贴20人，享受省政府特殊津贴8人，江西省跨世纪学科带头人2人、江西省新世纪百千万工程人10人和赣鄱英才“555”工程领军人才7人。

拥有4个省部级优势科技创新团队、4个国家平台载体、12个省级重点实验室和工程技术中心、1个省级（重点）科技智库。建立了院士工作站和博士后工作站。加入了铜冶炼及加工国家工程技术中心，硅基LED国家工程技术中心及中国再生资源产业技术创新战略联盟、中国海洋监测设备产业技术创新战略联盟和全国地方科学院联盟。创办了《江西科学》、《热处理技术与装备》、《生物化工》、《江西能源》、《创新驱动发展动态》五种学术期刊。

江西省科学院在生物技术、新材料、轻工与化工、新能源与环境、信息技术、软科学等领域形成了自己的特色与优势。建院以来，先后完成了包括鄱阳湖区综合考察治理研究、高光学纯度L-乳酸生产及其应用研究等在内的科研成果1200余项，获得国家科技进步奖二等奖等国家、省（部）级以上科技奖励90余项，获得国家发明专利300余项，发表学术论文近5000篇。江西省科学院还培育扶持了一批院、所参股控股的科技示范企业，涉及科技企业服务、生物、化工、新材料、电子信息、环保、教育培训等领域。

2012年3月，江西省科学院成为江西省人民政府与中国科学院共建单位。2018年11月，中科院与江西省政府签署了共建中国科学院江西产业技术创新与育成中心（简称“中科院江西中心”）协议，江西省科学院成为中科院江西中心、江西省产业技术研究院依托单位，进入新的重要发展时期。

江西省科学院与加拿大农业部莱斯布里奇研究中心、德国全球自然基金会、澳大利亚昆士兰大学、乌克兰国家科学院、俄罗斯乌法国立航空大学、新加坡南洋理工大学、日本名古屋工业大学、韩国江原大学等10余个国家的30余所科研机构/高校建立了深度合作关系，合作领域主要集中在金属材料处理、动物健康养殖、太阳能开发与利用、科技战略研究、精细化工、生态与环保等领域。与上述科研机构、院校共同承担国家级、省级项目30余项，引进外籍专家100余人次到我院工作交流，人员交流、培训达200人次。建有1个国家级国际科技合作基地、1个省级国际科技合作基地、1个省级引智示范单位、1个省级引智平台、1个高水平国际合作科研平台。同时，加入了国际科学院协会和中俄科技联盟等高水平国际科技合作平台。

在新的历史时期，江西省科学院将深入实施“新时代12345”创新发展战略，面向国内外科技革命与产业变革前沿、面向全省经济社会发展重大需求、面向江西产业技术创新主战场、明确主攻方向，集聚创新要素，着力打造江西省“产业技术研发中心、生态文明研究中心、科技成果转移中心、创新战略传播中心”，努力建设成为国内一流的区域科技创新中心、重大产业技术策源地、高端科技人才集聚区、科技合作示范基地、重点高端科技智库。