新疆农垦科学院农产品加工研究所成立于1983年8月，研究所下设果蔬加工、果蔬贮藏与保鲜、畜产品加工、粮油加工四个研究室、一个综合办公室。全所科技人员16人。其中，研究员2人，副研究员5人，博士1人，硕士12人。建有一个院级重点实验室，研究所承担国家、兵团各类科研项目26项。建所至今，在果蔬保鲜和加工、冷饮、发酵、粮油深加工、乳制品、肉制品等方面获得授权国家专利10项，达到国内先进水平以上成果20多项。

  新建1076平方米中试车间；建立了玉米联产、方便粥、脉动压制禽蛋、变温压差膨化干燥、热风智能干燥、真空脉动压干燥、油脂精炼等7条中试生产线，生产9种产品。